Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LETMD1Q6P1Q0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LETMD1Q6P1Q0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms