Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KHDC3LQ587J8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KHDC3LQ587J8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms