Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL24A1Q17RW2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL24A1Q17RW2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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