Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACKR1Q16570 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACKR1Q16570 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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