Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNCBQ16143 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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