Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USF2Q15853 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USF2Q15853 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USF2Q15853 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
USF2Q15853 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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