Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NKX1-1Q15270 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NKX1-1Q15270 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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