Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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ODF1Q14990 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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ODF1Q14990 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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ODF1Q14990 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ODF1Q14990 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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