Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 GNAS-225ENST00000467227 543 ntTSL 310.1□□□□□ -0.798e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-227ENST00000468895 583 ntTSL 310.05□□□□□ -0.88e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.448e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 KPNB1-210ENST00000580573 556 ntTSL 39.81□□□□□ -0.842e-8■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 KHSRP-204ENST00000595112 745 ntTSL 319.64■□□□□ 0.736e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PSMB5-206ENST00000555895 444 ntTSL 317.64■□□□□ 0.411e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.39e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.189e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-213ENST00000552164 845 ntTSL 223.86■■□□□ 1.419e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 323.4■■□□□ 1.349e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 19e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.969e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 518.96■□□□□ 0.639e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.529e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.59e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-215ENST00000552754 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.079e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.089e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-207ENST00000548898 727 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.099e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CD63-206ENST00000548160 648 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.639e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CORO1C-205ENST00000546571 899 ntTSL 417.03■□□□□ 0.325e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 412.06□□□□□ -0.485e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CORO1C-213ENST00000550032 547 ntTSL 29.53□□□□□ -0.885e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 TRIM28-213ENST00000598355 714 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-8■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 U2AF2-204ENST00000587275 554 ntTSL 424.81■■□□□ 1.562e-8■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 KIF1B-207ENST00000470616 519 ntTSL 311.36□□□□□ -0.595e-9■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 YWHAB-208ENST00000633979 689 ntTSL 39.08□□□□□ -0.965e-8■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CCAR2-203ENST00000518989 453 ntTSL 516.28■□□□□ 0.21e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 U2SURP-215ENST00000493782 588 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.061e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 TPM3-217ENST00000504663 870 ntTSL 212.82□□□□□ -0.363e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 CCAR2-213ENST00000523801 549 ntTSL 410.98□□□□□ -0.651e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.441e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 U2SURP-210ENST00000485374 470 ntTSL 45.11□□□□□ -1.591e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 U2SURP-206ENST00000470400 881 ntTSL 34.65□□□□□ -1.671e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.671e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 U2SURP-217ENST00000600150 725 ntTSL 54.53□□□□□ -1.681e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 U2SURP-204ENST00000465175 571 ntTSL 44.53□□□□□ -1.681e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 U2SURP-201ENST00000461591 1580 ntTSL 24.37□□□□□ -1.711e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 U2SURP-213ENST00000491827 824 ntTSL 34.27□□□□□ -1.731e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.753e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.823e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 SDHA-218ENST00000515752 1809 ntTSL 518.68■□□□□ 0.581e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.667e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.417e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 419.21■□□□□ 0.671e-28■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.217e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 DDB1-204ENST00000535147 2789 ntTSL 212.2□□□□□ -0.462e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 EIF4G1-232ENST00000466311 573 ntTSL 218.32■□□□□ 0.529e-13■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSME2-203ENST00000558273 1502 ntTSL 219.18■□□□□ 0.663e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSME2-204ENST00000558931 2754 ntTSL 517.39■□□□□ 0.373e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSME2-202ENST00000471700 706 ntTSL 317.33■□□□□ 0.363e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.043e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSME2-209ENST00000559453 1721 ntTSL 512.14□□□□□ -0.473e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.312e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.132e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.922e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.892e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-224ENST00000584460 1855 ntTSL 220.09■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.672e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GPS1-203ENST00000392357 4076 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 SND1-207ENST00000468621 494 ntTSL 46.52□□□□□ -1.374e-9■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 TRIM28-210ENST00000597618 609 ntTSL 212.4□□□□□ -0.425e-10■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 58.3□□□□□ -1.084e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.151e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.852e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSMB5-201ENST00000334454 796 ntTSL 523.69■■□□□ 1.382e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)25.79■■□□□ 1.722e-11■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-11■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 RPS8-205ENST00000474582 391 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.142e-11■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 RPS8-206ENST00000484599 852 ntTSL 313.95□□□□□ -0.182e-11■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.32e-11■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 RPS8-203ENST00000464658 898 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-11■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 MBNL3-209ENST00000442191 840 ntTSL 23.79□□□□□ -1.86e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.357e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.157e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.117e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.157e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.297e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.737e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 IMMT-205ENST00000419070 2172 ntTSL 58.2□□□□□ -1.17e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 TNRC18-210ENST00000497663 588 ntTSL 218.66■□□□□ 0.581e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 GTF3C1-206ENST00000566779 645 ntTSL 312.51□□□□□ -0.414e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 CCAR2-207ENST00000521020 614 ntTSL 39.45□□□□□ -0.92e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 VIL1-202ENST00000392114 1968 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.434e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 CCT6A-203ENST00000462133 665 ntTSL 313.56□□□□□ -0.243e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSMD4-203ENST00000427779 649 ntTSL 320.83■□□□□ 0.931e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSMD4-206ENST00000453615 371 ntTSL 310.6□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 ACTR3-207ENST00000489779 545 ntTSL 24.5□□□□□ -1.696e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)26.23■■□□□ 1.792e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 517.45■□□□□ 0.388e-8■■□□□ 12.2
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 166 ms