Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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