Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRDNQ13061 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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