Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSTF3Q12996 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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