Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFX1Q12986 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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