Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC8Q09428 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
ABCC8Q09428 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ABCC8Q09428 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms