Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RBBP4Q09028 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RBBP4Q09028 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms