Protein–RNA interactions for Protein: Q08426

EHHADH, Peroxisomal bifunctional enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHHADHQ08426 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHHADHQ08426 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHHADHQ08426 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms