Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLEQ07864 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLEQ07864 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLEQ07864 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLEQ07864 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLEQ07864 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLEQ07864 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLEQ07864 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLEQ07864 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLEQ07864 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms