Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAD51Q06609 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAD51Q06609 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms