Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABPB1Q06547 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABPB1Q06547 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms