Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALD1Q05682 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms