Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
OCA2Q04671 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
OCA2Q04671 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms