Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IRF9Q00978 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRF9Q00978 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms