Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL20P78556 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL20P78556 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL20P78556 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL20P78556 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL20P78556 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL20P78556 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL20P78556 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL20P78556 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL20P78556 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL20P78556 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL20P78556 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL20P78556 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL20P78556 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL20P78556 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL20P78556 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL20P78556 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL20P78556 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL20P78556 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL20P78556 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL20P78556 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms