Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOBP62745 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOBP62745 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOBP62745 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOBP62745 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms