Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLTPP55058 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLTPP55058 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLTPP55058 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PLTPP55058 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PLTPP55058 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PLTPP55058 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PLTPP55058 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms