Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD23BP54727 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms