Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
IQGAP1P46940 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IQGAP1P46940 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IQGAP1P46940 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms