Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ITGA3P26006 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms