Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA6P23229 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA6P23229 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms