Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGFR4P22455 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms