Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms