Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFTA3P0C7M3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFTA3P0C7M3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms