Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPBP07199 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPBP07199 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPBP07199 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPBP07199 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPBP07199 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPBP07199 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPBP07199 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPBP07199 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPBP07199 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPBP07199 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPBP07199 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPBP07199 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPBP07199 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPBP07199 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPBP07199 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms