Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA4P05014 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms