Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH6O60337 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms