Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ARPC1BO15143 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms