Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBTB39O15060 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms