Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP27XA6NNY8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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