Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF316A6NFI3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF316A6NFI3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms