Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf51A6NDU8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf51A6NDU8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms