Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPA6NDG6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms