Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM221AA4D161 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms