Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP3Q9Y6F1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP3Q9Y6F1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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