Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms