Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB11Q9Y547 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms