Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAN1Q9Y2M0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAN1Q9Y2M0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms