Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms