Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLKQ9UBT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms