Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms