Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC3Q9NUV7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms